（一）农业面源污染严重，（二）生活污水污染加剧，（三）湖面管理较为混乱
治理污染的措施及对策
（一）加强领导，明确职责，逐步理顺水源管理体制；高塘湖水资源治理保护工作涉及多地政府多个部门，需要多方参与配合。市委、市政府应本着科学发展、可持续发展的战略思路，联合湖域内其他市、县及相关部门，向省一级层面反映问题，制定高塘湖水资源治理保护总体方案，提出目标任务，制定措施对策，明确各方职责，逐步解决多头管理、体制不畅的问题。
（二）完善制度，强化措施，不断加大污染整治力度；完善水域水质及水污染监测体系建设，核定重点水域纳污能力，实施排污总量控制。
  （三）调整工业结构，优化工业布局，降低水环境污染负荷；
  （四）发展生态农业，科学使用化肥、农药，减少农业面源污染；建立有机农业管理系统和推广测土配方施肥技术，根据作物生长发育的需要和利用率施用肥料。
（五）推行规模养殖，发展生态产业，控制畜禽养殖业污染；
  （六）建设完善镇村生活污水管网收水系统，提高生活污水集中处理率。